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premier5官方版為有生物研究需求的用戶打造的資料查詢平臺，特色的引物功能能更好的去檢索所需數(shù)據(jù)。有了該軟件的支持，你就能更好的去處理關于生物方面的實驗，是實驗室的好幫手。
Primer Premier5是由加拿大Premier Biosoft公司開發(fā)的分子生物學引物設計軟件，主要用于設計PCR（聚合酶鏈式反應）引物。
1、在本站下載解壓壓縮包，得到Premier5 64位安裝包和注冊機；
2、打開"Primer Premier 5"文件，找到EXE文件點擊開始，軟件無需安裝，打開即可使用；
3、打開軟件之后將會彈出以下界面，點擊Active Product按鈕，看到一個2位數(shù)的Machine ID；
4、把Machine ID輸入Primer Keygen，點擊Generate生成激活碼；
5、把激活碼輸入Primer Premier，點擊ok即可彈跳出成功的指示；
1、進入軟件之后，主界面如下圖所示；
2、點擊下雨紅框里面的Primer；
3、點擊下圖紅框里面的Search，設置好了之后，點擊OK；
4、點擊Align，可以進行快速的轉(zhuǎn)換，點擊OK即可轉(zhuǎn)換。
一、引物設計
1、打開DNA序列后點擊按鈕primer，出現(xiàn)“search criteria”窗口，有多種參數(shù)可以調(diào)整
2、搜索目的(Seach For)有三種選項，PCR 引物(PCR Primers)、測序引物(Sequencing Primers)和雜交探針(Hybridization Probes)
3、搜索類型(Search Type)可選擇分別或同時查找上、下游引物(Sense/Anti-sense Primer，或Both)，或者成對查找(Pairs)，或者分別以適合上、下游引物為主(Compatible with Sense/Anti-sense Primer)。另外還可改變選擇區(qū)域(Search Ranges)，引物長度(Primer Length)，選擇方式(Search Mode)，參數(shù)選擇(Search Parameters)等等
4、使用者可根據(jù)自己的需要設定各項參數(shù)。如果沒有特殊要求，建議使用默認設置。然后按search，隨之出現(xiàn)的Search Progress 窗口中顯示Search Completed 時，再按OK，這時搜索結果以表格的形式出現(xiàn)，有三種顯示方式，上游引物(Sense)，下游引物(Anti-sense)，成對顯示(Pairs)。默認顯示為成對方式，并按優(yōu)劣次序(Rating)排列，滿分為100，即各指標基本都能達標
二、限制性酶切點分析及基元查找功能
1、其主要功能在主界面上一目了然。限制性酶切點分析及基元查找功能比較簡單，點擊該功能按鈕后，選擇相應的限制性內(nèi)切酶或基元(如-10 序列，-35 序列等)，按確定即可
2、常見的限制性內(nèi)切酶和基元一般都可以找到,你還可以編輯或者添加新限制性內(nèi)切酶或基元
三、引物修飾編輯
1、在需要對引物進行修飾編輯時，如在5’端加入酶切位點，可點擊，然后修改引物序列
2、若要回到搜索結果中，則點擊按鈕。如果要設計簡并引物，只需根據(jù)源氨基酸序列的物種來源選擇前述的八種遺傳密碼規(guī)則，反推至DNA 序列即可
3、對簡并引物的分析不需像一般引物那樣嚴格
4、總之，“Premier”有優(yōu)秀的引物自動搜索功能，同時可進行部分指標的分析，而且容易使用，是一個相當不錯的軟件
四、引物點擊
1、點擊其中一對引物，如第1#引物，并把上述窗口挪開或退出，顯示“Peimer Premier”主窗口，所得結果分三部分，
2、模板及產(chǎn)物位置，中間是所選的上下游引物的一些性質(zhì)，最下面是四種重要指標的分析，包括發(fā)夾結構(Hairpin)，二聚體(Dimer)，錯誤引發(fā)情況(False Priming)，及上下游引物之間二聚體形成情況(Cross Dimer)
3、當所分析的引物有這四種結構的形成可能時，按鈕由變成，點擊該按鈕，在左下角的窗口中就會出現(xiàn)該結構的形成情況
4、一對理想的引物應當不存在任何一種上述結構，因此最好的情況是最下面的分析欄沒有，只有。值得注意的是中間一欄的末尾給出該引物的最佳退火溫度
特異性分析：
檢測引物自互補性、二聚體、發(fā)夾結構等問題，避免非特異性擴增。
引物設計：
自動生成 PCR引物、測序引物、雜交探針等，支持簡并引物設計（根據(jù)氨基酸保守序列反推DNA序列）。
多重設計：
針對同一模板設計多重引物，提升實驗靈活性。
參數(shù)優(yōu)化：
可設置引物長度、GC含量、退火溫度（Tm值），確保PCR效率與準確性。
1、該軟件分為四大塊，尤其常用的是引物設計、限制性內(nèi)切酶位點分析和DNA 基元(motif)查找
2、給專業(yè)人員帶來的極大的便利，立足點按照引物設計的基本原則，只是更加快速和自動化而已
3、我們可以直接提交模板序列到特定網(wǎng)頁，如著名的primer3，得到設計好的引物，也可以在本地計算機上運行引物設計專業(yè)軟件
適用于分子生物學實驗中的引物設計需求，如測序驗證、基因克隆等，可顯著提高實驗成功率。
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